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Montanana Frederic, Bioinformaticien

Frédéric Montañana

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Développeur Logiciel

Je suis développeur J2EE chez Modul-Bio. J'ai 28 ans et je suis actuellement en poste chez Modul-Bio depuis mai 2013.

En ce moment :

Age : 29 ans
Employeur actuel Modul-Bio

CV

Emplois

CDI Développeur Logiciel Depuis Mai 2013 Modul-Bio

Développement de l'interface Homme-Machine des logiciels Modul-Bio.

CDD Bioinformatique Mars 2011 - Présent Centre d'Immunologie de Marseille Luminy

Ingénieur d'études au Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy dans le laboratoire de Marc Dalod. Analyses des données de puces générées dans le cadre du projet collaboratif avec Sanofi Aventis. Création d'un LIMS (Laboratory Interface Managment System) pour l'ensemble de l'institut.

CDD Bioinformatique Mars 2009 - Mars 2011 Centre d'Immunologie de Marseille Luminy

Stage en laboratoire, suivi d'un CDD, au Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy dans le laboratoire de Jonathan Ewbank. Adaptation d'une base de données et de son interface pour un criblage à l'échelle du génome de Caenorhabditis elegans

Stage Bioinformatique Mars - Mai 2008 TAGC

Création d'un outil pour le reformatage des résultats de MASCOTT avec le Docteur Samuel Grangeau.

Enseignement

Tutoriel sur l'analyse de données de puces à ADN Janvier 2013 EMBO - LACI

Tutoriel avancé sur l'utilisation du logiciel Gene Set Enrichment Analysis (GSEA), pour analyser des données de plusieurs plateformes et de plusieurs organismes durant le EMBO - LACI meeting

Formation

« Master Sciences »
« Bioinformatique, Biologie structurale et Génomique » 2007 - 2009 Université de la Méditerranée (Aix-Marseille II)

Lors de ce Master, j'ai pu apprendre à mettre mes connaissances informatiques au service de la biologie et les approfondir.

« Licence Sciences et technologie »
« Sciences de la vie » spécialité « Biochimie Physiologie et Neurosciences » 2004 - 2007 Université Paul Cézanne (Aix-Marseille III)

Apprentissage des techniques de biochimie tels que PCR,RT-PCR, CCM ou Western Blot.

Compétences

HTML5, CSS3 Design de l'interface

PHP, JAVA Code

Javascript VanillaJS & jQuery

SQL Création et optimisation de base de données

Environnement GNU/Linux Utilisation travail & personnel

Analyse de MicroArray R, BioConductor, GSEA, Cluster, DAVID, PCA, Mev, GeneE

Eclipse Outil de travail

Hobbies

Sports HandBall, Squash, Football, VTT

Guitare Classique

Projets

CILEX LIMS CIML Interface for Laboratory EXperiments

CILEX est un projet en cours à l'échelle de l'institut du CIML pour stocker l'ensemble des données des différentes expériences réalisées au CIML. Se basant sur les minimums d'informations tels que le MIARE ou le MIAME, ce LIMS se veut compatible avec les bases de données publiques comme GEO et CytoBank entre autres.

CILEX Logo

CILEX LogoLIMS

CILEX Samples

Gerer ses échantillons sur CILEXLIMS

CILEX Print

Imprimer ce qui est importantLIMS

CILEX GEO

Ajouter des données publiques à ses expériences de pucesLIMS

ICeE LIMS Interface for Caenorhbditis elegans Experiments

ICeE est un LIMS qui permet de stocker des données et métadonnées issues d'expériences sur C. elegans, nottament en haut débit, et de retrouver plus facilement les résultats. Sous licence GPL (Licence publique générale GNU), ce LIMS est composé d'une base de données MySQL et d'une interface web XHTML-PHP. ICeE est disponible librement sur la plateforme Sourceforge.
Poster de présentation à Los Angeles - Poster de présentation à Madison

ICeE Home

Page d'accueilICeE

Experiments in ICeE

Les types d'experiencesICeE

Search in ICeE

La fonction rechercheICeE

BubbleGUM: automatic extraction of phenotype molecular signatures and comprehensive visualization of multiple Gene Set Enrichment Analyses. Publication Lionel Spinelli, Sabrina Carpentier, Frédéric Montañana-Sanchis, Marc Dalod and Thien-Phong Vu Manh

Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, Université de la Méditerranée, Marseille, France. - BMC Genomics. 2015 Oct 19.

Gene expression profiling of the Peyer's patch mononuclear phagocyte system Publication Johnny Bonnardel, Clément Da Silva, Marion Masse, Frédéric Montañana-Sanchis, Hugues Lelouard, Jean-Pierre Gorvel

Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, Université de la Méditerranée, Marseille, France. - Genomics Data. 2015 May 9.

Innate and adaptive immune functions of peyer's patch monocyte-derived cells. Publication Johnny Bonnardel, Clément Da Silva, Sandrine Henri, Samira Tamoutounour, Lionel Chasson, Frederic Montañana-Sanchis, Jean-Pierre Gorvel, Hugues Lelouard

Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, Université de la Méditerranée, Marseille, France. - Cell Reports. 2015 May 5.

ICeE: An interface for C. elegans experiments Publication Frédéric Montañana-Sanchis, Renaud A Julien, Philippe Vaglio, Lisa R Matthews, Laurent Tichit & Jonathan J Ewbank

Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, Université de la Méditerranée, Marseille, France. - Taylor & Francis Online. 2014 Oct 30.

Human XCR1+ dendritic cells derived in vitro from CD34+ progenitors closely resemble blood dendritic cells, including their adjuvant responsiveness, contrary to monocyte-derived dendritic cells. Publication Balan S, Ollion V, Colletti N, Chelbi R, Montañana-Sanchis F, Liu H, Vu Manh TP, Sanchez C, Savoret J, Perrot I, Doffin AC, Fossum E, Bechlian D, Chabannon C, Bogen B, Asselin-Paturel C, Shaw M, Soos T, Caux C, Valladeau-Guilemond J, Dalod M.

Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, Université de la Méditerranée, Marseille, France. - J Immunol. 2014 Aug 15;193(4):1622-35. doi: 10.4049/jimmunol.1401243. Epub 2014 Jul 9.

Origins and functional specialization of macrophages and of conventional and monocyte-derived dendritic cells in mouse skin. Publication Tamoutounour S, Guilliams M, Montañana-Sanchis F, Liu H, Terhorst D, Malosse C, Pollet E, Ardouin L, Luche H, Sanchez C, Dalod M, Malissen B, Henri S.

Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, Université de la Méditerranée, Marseille, France. - Immunity. 2013 Nov 14;39(5):925-38. doi: 10.1016/j.immuni.2013.10.004. Epub 2013 Oct 31.

A comprehensive analysis of gene expression changes provoked by bacterial and fungal infection in C. elegans. Publication Engelmann I, Griffon A, Tichit L, Montañana-Sanchis F, Wang G, Reinke V, Waterston RH, Hillier LW, Ewbank JJ.

Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, Université de la Méditerranée, Marseille, France. - PLoS One. 2011;6(5):e19055. Epub 2011 May 13.

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163 avenue de Luminy
Case 935 - Parc Scientifique de Luminy
13009 Marseille, France

Telephone:

+33 4 91 82 82 50

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Vous connaissez le Konami code ?

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